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Research Article

Genetic structure and conservation of Teak (Tectona grandis) plantations in Côte d’Ivoire, revealed by site specific recombinase (SSR) [ pages 265-278 ]

Inza J. Fofana1, Yehili J.Lidah1, Nafan Diarrassouba2 Simon P. A. N’guetta1 Abdourahamane Sangare2 and Daniel Verhaegen3
    1 Laboratoire de génétique à l’UFR Biosciences Université de Cocody-Abidjan 22 BP. 582 Abidjan 22, Côte-d’Ivoire
    2 Laboratoire Central de Biotechnologie du CNRA 01 BP. 1740 Abidjan 01, Côte d’Ivoire
    3 CIRAD Biological System Department Research Unit 39: “Genetic Diversity and Breeding of Forest Tree Species” Campus International de Baillarguet TA A-39/C 34398 Montpellier Cedex 5, France.

Teak (Tectona grandis L.f; Verbenaceae) is a diploid species (2n=36). It is native to the tropical deciduous forests of India, Myanmar, Thailand and Laos. Snuffed for its aesthetic physical properties and its qualities, teak is becoming increasingly important in the forest plantation development in Côte d’Ivoire. To preserve the genetic resources of this species and ensure the supply of genetically superior quality germplasm for improvement and plantations, a core collection of superior genotypes with large genetic diversity is a prerequisite. This paper reports the use of site-specific recombinase (SSR) technology using microsatellite DNA markers to investigate the level of genetic variability, distribution of genetic variation and genetic relatedness in Tectona grandis grown in Côte d’Ivoire. The proportion of the total genetic variation resides within provenances (80.52 %) with 5.5 % of the variation occurring among populations of one region and 13.98 % among regions. The SSR markers showed a clear differentiation of the populations introduced in Côte d’Ivoire with an Fst = 0.21. The populations coming from the natural area were characterized by three clusters corresponding to South India, North India and Thailand. The study on the origin of African teak was close to North of India. However, Bambuku 7 population was an exception, as it seemed to have some affinity with Thailand populations. The use of SSR markers for conservation of teak forest diversity is discussed.

Key words: Tectona grandis, Teak wood, tree genetic diversity, tree genetic structure conservation, West Africa, Côte d’Ivoire.

Le teck (Tectona grandis L.f) est une espèce feuillue de la famille des Verbenacées avec 2n = 36 chromosomes. Il pousse naturellement dans toute la péninsule indienne, au Myanmar, en Thaïlande et au Laos. Prisé pour ses propriétés physiques et ses qualités esthétiques, le teck est la première essence de reboisement en Côte d’Ivoire. Pour conserver les ressources génétiques de cette espèce et assurer un approvisionnement de la qualité génétique du genoplasme, une collection des génotypes supérieurs avec une grande diversité génétique est une condition préalable. Cet article montre la technologie utilisée par les marqueurs microsatellites de l’ADN pour la caractérisation de la variabilité génétique, la distribution de la variation génétique et les liaisons génétiques du Tectona grandis en Côte d'Ivoire. La proportion de la variation génétique totale réside à l’intérieur des provenances (80.52%) avec 5.5% de la variation qui se produit entre les populations d'une région et 13.98% entre les régions. Les marqueurs microsatellites ont montré une nette différenciation des populations introduites en Côte d'Ivoire avec un Fst = 0.21. Les populations provenant des aires naturelles ont été caractérisées par trois groupes correspondant à l’Inde du sud, à l’Inde du nord et à la Thaïlande. La recherche des origines des tecks africains a montré que ces derniers sont probablement originaires de l’Inde du nord. Cependant, la population Bambuku 7 a fait une exception, car elle semble avoir une affinité avec les populations de la Thaïlande. L'utilisation des marqueurs microsatellites pour la conservation de la diversité forestière du teck est discutée.

Mots clés: Tectona grandis, bois de Teck, diversité génétique de l’arbre, conservation de la structure génétique de l’arbre, Afrique de l’Ouest, Côte d'Ivoire.

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Volume 1: Issue 3
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